Een Commanding Officer (of CO) is de officier met de hoogste rangen en commander van een eenheid. Op sterrenschepen heeft de CO de rang van Captain of Commander. Op sterrenbasissen kan dit ook een Admiral zijn.

Op sterrenschepen wordt de bevelhebber aangesproken met "Captain", ongeacht hun werkelijke rang. (DS9: "Behind the Lines")

Over het algemeen dragen bevelhebbers Starfleet uniformen in de kleur van de commando divisie, maar hier zijn uitzonderingen mogelijk.