De Derde vloot was een Federatie Alliantie vloot die deelnam aan de Dominion Oorlog.

Deze vloot bleef achter om de Aarde te beschermen, terwijl elementen van de Tweede, Vijfde en de Negende vloot deelnamen aan de verovering van ruimtestation Deep Space 9 in 2374. (DS9:"Favor the Bold")

Het is niet duidelijk of deze vloot verantwoordelijk is voor het verwoesten van de Breen vloot tijdens de aanval op San Francisco.

Om de Derde vloot te versterken vroeg Admiral William Ross aan Senator Kimara Cretak om twee aanvalsvleugels met Romulan Oorlogsvogels te sturen. (DS9:"Image in the Sand")