Een flag officer is een historische marine en militaire rang en een moderne Starfleet titel. Over het algemeen refereert het aan een Rear Admiral of een hogere rang. De term geeft elke officier aan die een eskader van schepen commandeert, mogelijkerwijs in samenstelling met de schepen onder hun commando.

Starfleet Generale Order 15 stelt: Geen enkele flag officer mag zich in gevaarlijk gebied begeven zonder een bewapende escorte. ("Star Trek II: The Wrath of Khan").