Methaan (CH4) is de eenvoudigste, reukloze, koolwaterstof. Bij kamertemperatuur heeft het een lagere dichtheid dan lucht.
Het komt op vele planeten en manen voor, zoals Aarde en Titan. De atmosfeer van een klasse K planeet (zoals Theta 116 VIII) bestaat uit methaan, stikstof en vloeibare neon. (TNG: "The Royale")
Het Axanar ras ademt een stikstof-methaan atmosfeer in. (ENT: "Fight or Flight")
Klaang, een Klingon boodschapper, was in 2151 verantwoordelijk voor de verwoesting van een graansilo op Aarde, die eigendom was van Moore, een boer. In de silo bevond zich ook methaan, dat vrijkwam toen deze ontplofte, waarbij de twee Suliban agenten omkwamen die Klaang achtervolgden. (ENT: "Broken Bow")
In 2364 vond een explosie plaats van een methaan-achtig gas in de Sigma III kolonie op Quadra Sigma III. (TNG: "Hide and Q")
Methaan is giftig voor de meeste humanoïde levensvormen en is een bijproduct van industrie en technologie. Veel hogere methaanconcentraties, samen met koolstofmonoxide en fluor, werden gedecteerd in de atmosfeer van Aarde in een alternatieve tijdlijn waarin de Borg de planeet in 2373 hadden geassimileerd. ("Star Trek: First Contact")